246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2487 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  63.73 
 
 
308 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  61.56 
 
 
307 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  62.21 
 
 
320 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  61.18 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  60.93 
 
 
343 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  61.24 
 
 
307 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  318  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  53.59 
 
 
307 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  54.1 
 
 
307 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  56.48 
 
 
307 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  55.48 
 
 
308 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  60.86 
 
 
308 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  50.81 
 
 
307 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  55.63 
 
 
306 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  55.33 
 
 
316 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  50.83 
 
 
306 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  55.33 
 
 
316 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  52.3 
 
 
310 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  51.16 
 
 
307 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  50 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  49.67 
 
 
306 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  49.35 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  50.33 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  46.51 
 
 
315 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  49.01 
 
 
307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  51.15 
 
 
307 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50.5 
 
 
307 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  50.83 
 
 
307 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  41.5 
 
 
305 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  45.51 
 
 
304 aa  215  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  44.04 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  43.48 
 
 
303 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  41.41 
 
 
296 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 
312 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  34.64 
 
 
313 aa  161  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  43.33 
 
 
301 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  33.45 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  30.99 
 
 
394 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
352 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30.11 
 
 
356 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  29.21 
 
 
350 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.26 
 
 
356 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 
420 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 
349 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.14 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
415 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  25.83 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 
350 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30.5 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  29.17 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  28.62 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  30.04 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  25.72 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.99 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.6 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  22.93 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
443 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  22.26 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  23.45 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  24.15 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  30.25 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  26.59 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.4 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  29.68 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  29.13 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  25.52 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  22.57 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.28 
 
 
266 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.56 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.56 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
329 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  23.53 
 
 
254 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  29.69 
 
 
283 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4500  hypothetical protein  23.18 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116291 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  25.75 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  27.8 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.18 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.79 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  28.01 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  29.74 
 
 
269 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  24.82 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  30.14 
 
 
330 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  21.05 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  21.05 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.97 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  46.97 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  36.92 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  26.03 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  27.27 
 
 
360 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>