More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2393 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  60.64 
 
 
376 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  58.78 
 
 
376 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  57.71 
 
 
376 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  53.49 
 
 
376 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  49.2 
 
 
376 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  43.25 
 
 
361 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  41.71 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  44.44 
 
 
373 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  38.77 
 
 
374 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  39.13 
 
 
371 aa  272  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  38.75 
 
 
399 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  38.94 
 
 
374 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  42.94 
 
 
376 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  41.11 
 
 
372 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  36.41 
 
 
377 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  34.25 
 
 
379 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  34.08 
 
 
374 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.98 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.98 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 
393 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.71 
 
 
388 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  32.93 
 
 
369 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.2 
 
 
377 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.68 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.86 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.53 
 
 
382 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30.82 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  32.76 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.38 
 
 
378 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
378 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 
369 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.32 
 
 
391 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.32 
 
 
391 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  32.51 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  28.49 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.85 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.49 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
390 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28.89 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 
362 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.62 
 
 
377 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.99 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
425 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.73 
 
 
377 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.54 
 
 
395 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.42 
 
 
408 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.38 
 
 
364 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.45 
 
 
399 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  30.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 
389 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 
408 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
408 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.44 
 
 
414 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.72 
 
 
408 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
419 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.38 
 
 
388 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  31.23 
 
 
389 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  31.23 
 
 
389 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  32.01 
 
 
401 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.18 
 
 
397 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.07 
 
 
377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.18 
 
 
414 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  27.16 
 
 
402 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.09 
 
 
364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.41 
 
 
411 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 
383 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.11 
 
 
377 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.79 
 
 
360 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.95 
 
 
414 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 
388 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.21 
 
 
374 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  29.22 
 
 
467 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.89 
 
 
426 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  26.92 
 
 
440 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  26.92 
 
 
440 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.22 
 
 
387 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  26.92 
 
 
440 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  26.92 
 
 
440 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
410 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  48.15 
 
 
123 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  31.3 
 
 
382 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.41 
 
 
398 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.05 
 
 
392 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  27.17 
 
 
397 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  27.17 
 
 
397 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  27.17 
 
 
397 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
396 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  27.17 
 
 
397 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.58 
 
 
384 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.64 
 
 
388 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>