171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2281 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
595 aa  1197    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  56.22 
 
 
575 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  54.39 
 
 
574 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  52.29 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  34.32 
 
 
567 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  34.14 
 
 
567 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  34.14 
 
 
567 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  35.34 
 
 
442 aa  254  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.71 
 
 
583 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  31.12 
 
 
607 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  32.81 
 
 
550 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.89 
 
 
585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  31.17 
 
 
553 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.56 
 
 
586 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.46 
 
 
572 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31 
 
 
556 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.99 
 
 
554 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.24 
 
 
554 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  31.57 
 
 
548 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.09 
 
 
567 aa  174  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  30.14 
 
 
545 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  29.76 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.73 
 
 
576 aa  157  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.08 
 
 
578 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 
558 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.28 
 
 
569 aa  142  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  27.03 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.32 
 
 
692 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 
592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.82 
 
 
561 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.4 
 
 
596 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.4 
 
 
596 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25.4 
 
 
596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  28.9 
 
 
581 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  25.1 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  23.52 
 
 
551 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  23.52 
 
 
551 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.09 
 
 
567 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.75 
 
 
587 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.88 
 
 
571 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.64 
 
 
559 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  25.35 
 
 
597 aa  104  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  27.92 
 
 
568 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.64 
 
 
568 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.43 
 
 
545 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.9 
 
 
599 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.27 
 
 
592 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.14 
 
 
692 aa  87.4  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.19 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.42 
 
 
747 aa  83.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  31.03 
 
 
595 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  23.94 
 
 
569 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  29.56 
 
 
564 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  20.59 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.19 
 
 
569 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.92 
 
 
1349 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.92 
 
 
1391 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.27 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  28.51 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.26 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  23.82 
 
 
565 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.26 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  28.1 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.63 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  28.1 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  26.1 
 
 
585 aa  67.4  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.44 
 
 
1570 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.8 
 
 
588 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  28.19 
 
 
590 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.73 
 
 
563 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.83 
 
 
558 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.05 
 
 
562 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  25.58 
 
 
574 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.09 
 
 
568 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  27.36 
 
 
588 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  29.63 
 
 
561 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  30.14 
 
 
590 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  29.82 
 
 
578 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.38 
 
 
586 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.63 
 
 
568 aa  64.3  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.46 
 
 
584 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  24.26 
 
 
565 aa  63.9  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.83 
 
 
570 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.23 
 
 
572 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  22.99 
 
 
562 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  22.99 
 
 
562 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  29.13 
 
 
584 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.72 
 
 
562 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  21.81 
 
 
551 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.95 
 
 
579 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  22.29 
 
 
597 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 
561 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.02 
 
 
594 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  25.06 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  29.52 
 
 
584 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  22.33 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  21.61 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  22.33 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>