127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2277 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  100 
 
 
980 aa  1936    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  35.52 
 
 
1152 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  35.97 
 
 
2365 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  35.97 
 
 
2346 aa  224  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.43 
 
 
2396 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.31 
 
 
1508 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.22 
 
 
1285 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.88 
 
 
1848 aa  214  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  32.65 
 
 
1550 aa  211  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  30.78 
 
 
1119 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.65 
 
 
2003 aa  204  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  28.74 
 
 
650 aa  201  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.56 
 
 
3506 aa  197  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  34.92 
 
 
1056 aa  194  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  32.29 
 
 
986 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  32.2 
 
 
995 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.53 
 
 
1227 aa  183  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  31.34 
 
 
983 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.43 
 
 
1028 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.69 
 
 
1029 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  29.11 
 
 
1038 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.52 
 
 
4238 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.52 
 
 
4238 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.52 
 
 
3822 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.92 
 
 
1519 aa  171  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  29.62 
 
 
1001 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  31.64 
 
 
3954 aa  170  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  29.76 
 
 
1055 aa  167  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.4 
 
 
919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  27.61 
 
 
991 aa  164  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.42 
 
 
1001 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  28.63 
 
 
995 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 
1033 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  32.22 
 
 
1011 aa  161  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  29.46 
 
 
1004 aa  161  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  28.88 
 
 
1782 aa  160  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  29.09 
 
 
1006 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  30.77 
 
 
1130 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  29.02 
 
 
985 aa  156  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  32.96 
 
 
677 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 
1164 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  30.71 
 
 
1062 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  26.57 
 
 
990 aa  153  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  29.42 
 
 
1129 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  29.42 
 
 
1131 aa  152  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  29.2 
 
 
1129 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  29.2 
 
 
1131 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  29.2 
 
 
1131 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  29.2 
 
 
1131 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  29.62 
 
 
994 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.92 
 
 
1333 aa  148  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  29.65 
 
 
1131 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  29.87 
 
 
1016 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.89 
 
 
972 aa  146  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.54 
 
 
1125 aa  144  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.72 
 
 
1011 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  25.4 
 
 
1881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 
488 aa  118  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 
1053 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.13 
 
 
1769 aa  108  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.14 
 
 
407 aa  105  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.68 
 
 
816 aa  97.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.79 
 
 
1369 aa  95.9  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.07 
 
 
774 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.08 
 
 
1489 aa  92.8  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  47.66 
 
 
145 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.02 
 
 
1078 aa  91.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.32 
 
 
1134 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  29.75 
 
 
1179 aa  90.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  30.04 
 
 
972 aa  89.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3799  outer membrane autotransporter barrel protein  32.19 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.23 
 
 
913 aa  84.7  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  30.49 
 
 
1154 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  24.34 
 
 
2711 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.2 
 
 
814 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.64 
 
 
1156 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.45 
 
 
915 aa  77.4  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.24 
 
 
907 aa  77  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.02 
 
 
1081 aa  75.1  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.79 
 
 
1012 aa  74.7  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.92 
 
 
910 aa  73.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 
1180 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  28.03 
 
 
939 aa  72  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.31 
 
 
1532 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.04 
 
 
926 aa  70.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  25.62 
 
 
1019 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.69 
 
 
882 aa  68.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  26.08 
 
 
1111 aa  67.8  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 
2083 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.46 
 
 
960 aa  65.1  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  29.66 
 
 
1025 aa  64.3  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.04 
 
 
906 aa  63.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.84 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.3 
 
 
1325 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.03 
 
 
1004 aa  61.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  28.19 
 
 
763 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  26.26 
 
 
1130 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  24.29 
 
 
311 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.98 
 
 
1066 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.48 
 
 
759 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>