22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2232 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  100 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.82 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  35.19 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  31.76 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  33.58 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  37.82 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  32.34 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  31.6 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  33.64 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  30.97 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  33.33 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  35.07 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  32.62 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  31 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  32.09 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  28.77 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.2 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  37.08 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  29.48 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  28.63 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.23 
 
 		 161 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>