More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2229 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  64.48 
 
 		 575 aa  722    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  84.01 
 
 		 565 aa  969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  81.46 
 
 		 569 aa  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  80.18 
 
 		 570 aa  937    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  77.09 
 
 		 566 aa  868    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  78.89 
 
 		 582 aa  927    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  80.18 
 
 		 570 aa  936    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  72.29 
 
 		 566 aa  842    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  75.89 
 
 		 568 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  83.69 
 
 		 567 aa  970    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  68.34 
 
 		 569 aa  753    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  68.15 
 
 		 561 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  84.67 
 
 		 569 aa  978    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 571 aa  1145    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  81.64 
 
 		 569 aa  947    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  65.7 
 
 		 573 aa  751    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  76.73 
 
 		 566 aa  865    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  84.37 
 
 		 565 aa  978    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  69.91 
 
 		 566 aa  768    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  68.15 
 
 		 561 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  69.2 
 
 		 558 aa  765    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  75.4 
 
 		 567 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  83.72 
 
 		 565 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  84.37 
 
 		 565 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  83.69 
 
 		 566 aa  972    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  79.65 
 
 		 570 aa  932    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  69.89 
 
 		 558 aa  784    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  80.14 
 
 		 570 aa  925    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  77.09 
 
 		 566 aa  868    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  70.92 
 
 		 558 aa  796    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  70.04 
 
 		 570 aa  749    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  76.23 
 
 		 569 aa  870    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  68.47 
 
 		 566 aa  765    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  76.46 
 
 		 573 aa  862    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  68.75 
 
 		 569 aa  764    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  68.16 
 
 		 571 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  68.15 
 
 		 561 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  80.99 
 
 		 577 aa  946    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  75.99 
 
 		 569 aa  865    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  65.71 
 
 		 571 aa  751    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  75.4 
 
 		 567 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  53.13 
 
 		 570 aa  588  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  49.54 
 
 		 555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  49.82 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  50.47 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  49.73 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 570 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  49.55 
 
 		 555 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  49.55 
 
 		 555 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  49.55 
 
 		 555 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  49.91 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  49.54 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  50.36 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 570 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  49.55 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  49.09 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  49.54 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 576 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 589 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 576 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  49.54 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 569 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  49.54 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2668  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 557 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  50.47 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 576 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 576 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2580  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 557 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000500826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  50.36 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1955  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132161  normal  0.358522 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  49.53 
 
 		 557 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  48.82 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  48.38 
 
 		 559 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  49.47 
 
 		 570 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>