44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2191 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  45.87 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  37.86 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  37.59 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  35.94 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  32.86 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  37.78 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  35.09 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  29.59 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  28.45 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  36.22 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  30.66 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  36.7 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  26.05 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  31.85 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  29.29 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  31.52 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  28.26 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  30.65 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  28.29 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  36.29 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  34.09 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  28.28 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  29.41 
 
 		 133 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  28.8 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  27.91 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  28.06 
 
 		 159 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 		 132 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>