31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2164 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  290  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  47.45 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  47.45 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  43.17 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  45.52 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  38.85 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  44.53 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.12 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  39.24 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  39.58 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  32.84 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.59 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.87 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  29.79 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  29.79 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  37.62 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  31.47 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  36.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  29.93 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  28.26 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  29.17 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  30.22 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  28.15 
 
 		 134 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>