198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2146 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2146  porin  100 
 
 
255 aa  513  1e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  42.96 
 
 
258 aa  171  7e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  44.66 
 
 
248 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  44.81 
 
 
250 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  42.13 
 
 
232 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  40.23 
 
 
254 aa  147  2e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  39.15 
 
 
245 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  41.94 
 
 
248 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  36.21 
 
 
997 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  35.91 
 
 
237 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  38.52 
 
 
247 aa  129  4e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  35.27 
 
 
244 aa  129  4e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.93 
 
 
246 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  37.33 
 
 
283 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  37.5 
 
 
243 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.15 
 
 
254 aa  126  4e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  40.38 
 
 
207 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  38.08 
 
 
241 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  34.92 
 
 
578 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  34.63 
 
 
228 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  38.03 
 
 
260 aa  119  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  36.43 
 
 
239 aa  119  5e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  36.86 
 
 
261 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  36.68 
 
 
251 aa  118  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  37.23 
 
 
212 aa  117  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  37.31 
 
 
251 aa  117  2e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  39.41 
 
 
274 aa  117  2e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  34.57 
 
 
255 aa  117  2e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  36.09 
 
 
235 aa  114  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  38.71 
 
 
236 aa  114  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  38.55 
 
 
236 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  35.98 
 
 
240 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  35.64 
 
 
570 aa  112  7e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.71 
 
 
447 aa  111  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  36.68 
 
 
258 aa  111  1e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.72 
 
 
453 aa  110  2e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  35.02 
 
 
452 aa  110  2e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  34.44 
 
 
230 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.83 
 
 
250 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  35.88 
 
 
240 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  35.43 
 
 
229 aa  109  4e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  36.54 
 
 
240 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  35.74 
 
 
566 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.08 
 
 
245 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  35.71 
 
 
559 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  35.21 
 
 
562 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.85 
 
 
206 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  35.27 
 
 
241 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  36.74 
 
 
242 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  31.56 
 
 
274 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  35.38 
 
 
449 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  35.11 
 
 
570 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  31.07 
 
 
274 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  31.07 
 
 
274 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.49 
 
 
240 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.05 
 
 
206 aa  101  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  35.09 
 
 
449 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  36.36 
 
 
257 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.91 
 
 
279 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  37.31 
 
 
243 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.2 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  33.2 
 
 
285 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  36.05 
 
 
561 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  31.84 
 
 
251 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.1 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.74 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  32.07 
 
 
285 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  32.07 
 
 
285 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  32.39 
 
 
287 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  33.08 
 
 
225 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.2 
 
 
454 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  27.91 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  33.97 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  27.91 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  35.43 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  35.98 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  35.23 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  34.35 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  32.65 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  34.85 
 
 
237 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  32.48 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.21 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  32.62 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  31.84 
 
 
284 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  31.15 
 
 
228 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  36.21 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  33.07 
 
 
571 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  33.75 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18187e-05 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.52 
 
 
652 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.59 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  30.89 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  33.82 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  32.57 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.82 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  33.33 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  30.23 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  27.06 
 
 
234 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.83 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.65 
 
 
710 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  30.97 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>