41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2138 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  65.97 
 
 
481 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  75.53 
 
 
482 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  71.22 
 
 
476 aa  693    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  71.25 
 
 
483 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  74.95 
 
 
478 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  76.86 
 
 
476 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  74.74 
 
 
482 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  74.58 
 
 
476 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  74.74 
 
 
476 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  71.79 
 
 
480 aa  720    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  74.58 
 
 
476 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  73.89 
 
 
481 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  75.11 
 
 
482 aa  747    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  100 
 
 
476 aa  985    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  66.11 
 
 
481 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  71.46 
 
 
483 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  77.49 
 
 
474 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  70.21 
 
 
483 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  75.16 
 
 
478 aa  747    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  75.64 
 
 
477 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  76.06 
 
 
478 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  75 
 
 
475 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  73.94 
 
 
477 aa  733    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  73.49 
 
 
481 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  65.13 
 
 
476 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  65.13 
 
 
472 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  64.26 
 
 
473 aa  610  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  57.47 
 
 
471 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  57.78 
 
 
475 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  55.01 
 
 
474 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  53.94 
 
 
486 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  48.49 
 
 
469 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  48.49 
 
 
469 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  47.85 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  47.08 
 
 
472 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  47 
 
 
470 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  40.25 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  38.76 
 
 
485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  37.18 
 
 
480 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  38.17 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  38.33 
 
 
481 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>