More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2086 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  77.54 
 
 
286 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  76.84 
 
 
286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  70.89 
 
 
292 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
261 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  52.19 
 
 
259 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  53.14 
 
 
253 aa  275  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.36 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  54.2 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  54.85 
 
 
259 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 
259 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  54.59 
 
 
260 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 
265 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.24 
 
 
258 aa  269  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  54.2 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  53.81 
 
 
274 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.79 
 
 
259 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.74 
 
 
279 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52.23 
 
 
304 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.19 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  55.56 
 
 
264 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.61 
 
 
306 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.23 
 
 
304 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.99 
 
 
283 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.39 
 
 
285 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
264 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  51.82 
 
 
304 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.48 
 
 
289 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  50.2 
 
 
275 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.01 
 
 
284 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49 
 
 
252 aa  255  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.89 
 
 
287 aa  255  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.15 
 
 
254 aa  255  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.21 
 
 
263 aa  254  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.1 
 
 
257 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  52.38 
 
 
267 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  52.32 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  52.32 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  52.32 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  51.01 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.59 
 
 
288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.99 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49.37 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.99 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  53.85 
 
 
264 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  50.21 
 
 
301 aa  252  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  48.37 
 
 
303 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
267 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.29 
 
 
263 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.88 
 
 
273 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45 
 
 
272 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.84 
 
 
267 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
267 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.65 
 
 
251 aa  248  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
272 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.28 
 
 
278 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.77 
 
 
259 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
272 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.14 
 
 
297 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
261 aa  246  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
261 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  50 
 
 
262 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  50 
 
 
262 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  54.98 
 
 
262 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  53.57 
 
 
257 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  51.09 
 
 
259 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
278 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.08 
 
 
253 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.09 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.71 
 
 
280 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  51.55 
 
 
262 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  46.82 
 
 
277 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.21 
 
 
260 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.12 
 
 
267 aa  244  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.23 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  50.63 
 
 
295 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  51.02 
 
 
267 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.84 
 
 
315 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  54.47 
 
 
293 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  48.69 
 
 
288 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.65 
 
 
252 aa  242  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
254 aa  241  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  47.74 
 
 
276 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.32 
 
 
267 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  54.04 
 
 
293 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.83 
 
 
272 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  57.01 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.7 
 
 
271 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
260 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
256 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.21 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
261 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 
271 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  47.13 
 
 
263 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>