128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2020 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  70.14 
 
 
147 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  68.97 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  66.67 
 
 
142 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  63.01 
 
 
144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  63.38 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  66.92 
 
 
133 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  65.28 
 
 
148 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  62.22 
 
 
135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  61.11 
 
 
150 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  62.24 
 
 
142 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  59.15 
 
 
144 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  60.69 
 
 
147 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  61.48 
 
 
136 aa  167  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  60 
 
 
146 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  56.94 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  60.84 
 
 
158 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  57.93 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  59.03 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  57.93 
 
 
155 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  59.44 
 
 
140 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  58.45 
 
 
146 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  56.25 
 
 
140 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  58.74 
 
 
140 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  58.33 
 
 
154 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  55.41 
 
 
170 aa  155  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  67.86 
 
 
112 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  52.63 
 
 
146 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  47.37 
 
 
156 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  51.47 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  55.56 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  50.7 
 
 
171 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  48.63 
 
 
145 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  49.3 
 
 
271 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  48.59 
 
 
146 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  47.3 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  44.12 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  46.04 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  44.44 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  46.76 
 
 
168 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  45.39 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  39.35 
 
 
162 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  41.91 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  49.65 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  43.07 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  41.38 
 
 
170 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  46.72 
 
 
162 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  47.01 
 
 
153 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  43.33 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  36.62 
 
 
167 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  44.83 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  47.55 
 
 
147 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  42.95 
 
 
176 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  42.57 
 
 
184 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  41.48 
 
 
159 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  45.32 
 
 
168 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  45.32 
 
 
168 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  37.06 
 
 
166 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  41.79 
 
 
155 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  45.07 
 
 
180 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  46.72 
 
 
149 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  41.04 
 
 
155 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  46.04 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  46.04 
 
 
168 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  44.06 
 
 
166 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  40.44 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  43.7 
 
 
195 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  46.62 
 
 
148 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  41.04 
 
 
155 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  40.88 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  45.59 
 
 
148 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  40.88 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  40.88 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  37.41 
 
 
164 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  39.35 
 
 
168 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  40.14 
 
 
168 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  43.88 
 
 
168 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  44.36 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  39.01 
 
 
157 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  43.88 
 
 
168 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  42.66 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  42.66 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  43.97 
 
 
172 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  36.69 
 
 
164 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  42.25 
 
 
173 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  43.61 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  42.14 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  42.25 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>