164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1933 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  100 
 
 		 403 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 66 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 66 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 67 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 67 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 66 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 66 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 66 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 		 67 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  69.12 
 
 		 123 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 66 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 66 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 66 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 67 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 67 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  69.7 
 
 		 66 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 66 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 66 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 66 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 67 aa  87  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 66 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 66 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 66 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 66 aa  74.7  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 66 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  65 
 
 		 66 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  65 
 
 		 66 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  65 
 
 		 66 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 67 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  64.81 
 
 		 67 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 67 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 66 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  54.24 
 
 		 67 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 67 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 68 aa  58.5  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50.85 
 
 		 65 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  51.72 
 
 		 65 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  57  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 64 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 66 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 64 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 64 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 73 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  46.67 
 
 		 64 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 65 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 71 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  50.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 66 aa  50.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  60.47 
 
 		 65 aa  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  46.3 
 
 		 64 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 64 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 64 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 67 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 67 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  45 
 
 		 64 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 67 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 64 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 64 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  40.74 
 
 		 64 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 64 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.15 
 
 		 66 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  55.81 
 
 		 64 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 67 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 67 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 81 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 64 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 65 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 64 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  38.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 67 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>