84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1881 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  282  1e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  55.07 
 
 
147 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  49.66 
 
 
153 aa  145  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  50.66 
 
 
153 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  48.37 
 
 
153 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  52.67 
 
 
144 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  47.37 
 
 
151 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  48.2 
 
 
150 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  54.86 
 
 
148 aa  128  2e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  54.25 
 
 
153 aa  127  4e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  51.02 
 
 
148 aa  127  4e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  52.52 
 
 
149 aa  126  9e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  52.78 
 
 
151 aa  125  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  44 
 
 
155 aa  125  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  46.05 
 
 
152 aa  125  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  43.33 
 
 
155 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  50.68 
 
 
149 aa  116  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  42.45 
 
 
149 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  108  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  40.32 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  39.02 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  43.65 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  35.25 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  45.9 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  39.71 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  41.84 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  38.24 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  32.12 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  41.18 
 
 
156 aa  81.3  4e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  38.85 
 
 
151 aa  79  2e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  37.24 
 
 
151 aa  77.8  4e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  35.38 
 
 
152 aa  77.4  7e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  35.38 
 
 
152 aa  77.4  7e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  35.38 
 
 
152 aa  77.4  7e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  35.38 
 
 
152 aa  77.4  7e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.72435e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  34.62 
 
 
152 aa  77  9e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  39.01 
 
 
153 aa  75.5  2e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  35.38 
 
 
152 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  35.38 
 
 
152 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  34.62 
 
 
151 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  75.1  3e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  75.1  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  34.72 
 
 
149 aa  75.1  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  34.56 
 
 
147 aa  72.4  2e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  34.65 
 
 
150 aa  72.8  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  34.62 
 
 
150 aa  72  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  27.27 
 
 
150 aa  68.9  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  34.44 
 
 
153 aa  68.6  3e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  64.7  4e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  35.38 
 
 
150 aa  63.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  35.38 
 
 
150 aa  63.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  35.38 
 
 
150 aa  63.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  35.38 
 
 
150 aa  63.9  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  62  2e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  61.6  3e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  29.03 
 
 
154 aa  53.5  9e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  53.5  9e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  30.43 
 
 
143 aa  52  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.77 
 
 
144 aa  48.5  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  32.14 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  27.74 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  27.74 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.74 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1526  nodulation efficiency protein D (NfeD)  28.99 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  28.47 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  30.28 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.67 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.4 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.55 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.55 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.55 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.55 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  26.75 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  27.14 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  27.14 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  30.16 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  26.28 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>