More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1861 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  67.68 
 
 		 643 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  56.94 
 
 		 656 aa  767    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  67.74 
 
 		 657 aa  864    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  57.25 
 
 		 655 aa  771    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.99 
 
 		 650 aa  813    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  62.94 
 
 		 655 aa  795    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  65.13 
 
 		 643 aa  845    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  67.2 
 
 		 642 aa  862    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  65.6 
 
 		 642 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  64.85 
 
 		 642 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  56.96 
 
 		 655 aa  767    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  58.41 
 
 		 654 aa  772    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 650 aa  1322    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  65.29 
 
 		 643 aa  853    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  46.04 
 
 		 649 aa  568  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 647 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  45.41 
 
 		 649 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 646 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  45.01 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.53 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  44.91 
 
 		 651 aa  548  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 652 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 682 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  39.18 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 644 aa  475  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.55 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 648 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 654 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 661 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 648 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  38.47 
 
 		 648 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 648 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 653 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 661 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 645 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 		 653 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 648 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 653 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 651 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 648 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  37.25 
 
 		 656 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 654 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 		 636 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 634 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 659 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 623 aa  361  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 618 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 603 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 609 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 626 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 633 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 633 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 606 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 606 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 622 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 612 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 594 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 603 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 649 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 607 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.99 
 
 		 587 aa  249  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 592 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 635 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 617 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 612 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 599 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.78 
 
 		 602 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  26.8 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 603 aa  237  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 596 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 590 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.62 
 
 		 601 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  27.32 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 597 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  27.05 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 601 aa  230  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 597 aa  230  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 597 aa  230  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 616 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 601 aa  229  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>