More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1858 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 196 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  48.43 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 196 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 193 aa  168  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  33.96 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 200 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.78 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  26.44 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.59 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  24.19 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>