64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1840 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
312 aa  631  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  52.94 
 
 
315 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  52.35 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.07 
 
 
339 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  51.76 
 
 
257 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  61.18 
 
 
280 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.25 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.28 
 
 
332 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.25 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.99 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.97 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.67 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.67 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.63 
 
 
314 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.79 
 
 
268 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.23 
 
 
227 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.29 
 
 
220 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.5 
 
 
216 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  35 
 
 
258 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  35 
 
 
230 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.97 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.05 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  36.81 
 
 
220 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.05 
 
 
222 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  34.73 
 
 
210 aa  122  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.31 
 
 
221 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  36.53 
 
 
212 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 
212 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.91 
 
 
212 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
243 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.35 
 
 
223 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 
212 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
221 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.29 
 
 
198 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.95 
 
 
206 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 
203 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.36 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.49 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.45 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.48 
 
 
228 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.52 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.43 
 
 
236 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.62 
 
 
208 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.95 
 
 
214 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.14 
 
 
208 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.91 
 
 
202 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.42 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.47 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.9 
 
 
206 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.18 
 
 
212 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  29.51 
 
 
193 aa  47  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.53 
 
 
217 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.43 
 
 
207 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.26 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.89 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.69 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  25.76 
 
 
193 aa  44.3  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.47 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  21.47 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.5 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  37.5 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.4 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>