More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1820 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
144 aa  289  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  73.24 
 
 
143 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  74.45 
 
 
150 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  74.26 
 
 
151 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  70.21 
 
 
149 aa  206  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  70.83 
 
 
165 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  71.13 
 
 
143 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  70.37 
 
 
135 aa  201  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  73.13 
 
 
135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  66.91 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  69.63 
 
 
156 aa  197  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  69.12 
 
 
142 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  68.38 
 
 
142 aa  196  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  67.41 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  72.52 
 
 
139 aa  194  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  67.67 
 
 
137 aa  187  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  65.62 
 
 
137 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  67.19 
 
 
140 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  64.66 
 
 
140 aa  176  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  67.72 
 
 
137 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  66.67 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  61.15 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  64.06 
 
 
138 aa  168  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  57.25 
 
 
151 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  58.91 
 
 
158 aa  153  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  52.71 
 
 
144 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  57.98 
 
 
141 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  55.28 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  55.46 
 
 
142 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  54.47 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  53.44 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  51.59 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  50.39 
 
 
150 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 
176 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  46.09 
 
 
140 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  44.7 
 
 
152 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 
143 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  42.14 
 
 
167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  42.14 
 
 
167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 
167 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  41.8 
 
 
153 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
144 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 
143 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 
154 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  41.8 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  38.52 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  41.46 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  42.86 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 
143 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  41.27 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  42.86 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  41.22 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  44.17 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  42.15 
 
 
136 aa  94  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  40.5 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  40.83 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40 
 
 
148 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  38.84 
 
 
143 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  35.88 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  38.84 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  38.46 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  39.5 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  39.68 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  41.46 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  39.17 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  40.83 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  38.84 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  38.02 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  39.67 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  35.66 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  36.89 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  36.89 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  38.84 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  37.19 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  37.19 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>