More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1747 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 467 aa  938    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.59 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  50.8 
 
 		 450 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  48.13 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  47.74 
 
 		 469 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  48.79 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  48.79 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.29 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  51.12 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.55 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  52.9 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  47.23 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  48.4 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.58 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  46.58 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  45.15 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  43.45 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  44.92 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  44.5 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  46.57 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  44.29 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 		 444 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 450 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  46.95 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  47.73 
 
 		 452 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  48.1 
 
 		 452 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.02 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  43.9 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 469 aa  342  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.97 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  44.65 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 481 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  41.97 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  41.33 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.54 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 481 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  41.33 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  41.65 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 473 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 482 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.11 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  40.91 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 464 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.69 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  36.11 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 		 457 aa  324  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 453 aa  323  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 465 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 464 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  38.88 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.11 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>