More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1689 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1689  ribosomal protein L14  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  unclonable  0.000000000066103  unclonable  0.000000000208726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  94.51 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  94.51 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  93.41 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  92.31 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  92.31 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  91.21 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  91.21 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  94.44 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  94.44 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  77.19 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  77.19 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  91.21 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  92.31 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  92.31 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  92.31 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  92.22 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  91.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  91.11 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  94.32 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  91.11 
 
 		 122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  90 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  90 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  90 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  92.05 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  92.05 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  88.89 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  88.76 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  88.76 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  87.64 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  85.56 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  85.56 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  85.56 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  84.44 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  73.33 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000108066  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0330  50S ribosomal protein L14  68.57 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000213819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  66.96 
 
 		 123 aa  146  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001732  LSU ribosomal protein L14p (L23e)  67.89 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000162129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0999  ribosomal protein L14  81.82 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00274918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00740  50S ribosomal protein L14  67.89 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  82.22 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  80 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3699  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000119434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  76.67 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3991  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000125728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3626  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00182904  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3812  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000039471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  77.78 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0293  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194944  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3904  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000392566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  78.89 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  66.96 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  78.89 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  79.55 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  75.82 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  80.68 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4534  50S ribosomal protein L14  65.18 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143523  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  76.67 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0347  50S ribosomal protein L14  76.67 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  78.41 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1844  50S ribosomal protein L14  76.67 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0430762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  78.26 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  65.18 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000092381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000146326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  66.07 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3741  50S ribosomal protein L14  66.07 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000040815  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  77.17 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  77.78 
 
 		 122 aa  139  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  76.92 
 
 		 122 aa  140  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  76.67 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  75.82 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  76.14 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  75.82 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  77.78 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  79.55 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  74.44 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  76.09 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  74.44 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  76.09 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>