More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1661 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  100 
 
 		 498 aa  986    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  55.25 
 
 		 500 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  57.83 
 
 		 498 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  59.41 
 
 		 501 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  54.28 
 
 		 524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  52.92 
 
 		 522 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  56.44 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  58.95 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  57.63 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  54.55 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  59.52 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  54.09 
 
 		 524 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  53.31 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  56.39 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  59.35 
 
 		 498 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  58.38 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  55.83 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  53.71 
 
 		 520 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  53.29 
 
 		 588 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  52.78 
 
 		 578 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  55.94 
 
 		 511 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  55.74 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  53.12 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  55.2 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  50.54 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  52.05 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  50.31 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  49.78 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  46.32 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  49.37 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.73 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  47.02 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  50.23 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  48.13 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  48.35 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  48.13 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  44.89 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  44.89 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  44.07 
 
 		 527 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  43.06 
 
 		 524 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  42.76 
 
 		 497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  44.13 
 
 		 489 aa  352  7e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.07 
 
 		 517 aa  352  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.68 
 
 		 520 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  46 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  43.57 
 
 		 527 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.37 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.65 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.37 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  42.74 
 
 		 527 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.64 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.31 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.13 
 
 		 501 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  46.35 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.51 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  39.67 
 
 		 508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.4 
 
 		 483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.81 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.18 
 
 		 523 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  45.76 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  39.57 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.16 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  40.76 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  41.18 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  46.25 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.8 
 
 		 466 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.94 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  39.2 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  40.26 
 
 		 529 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  40.3 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.2 
 
 		 528 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.67 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.03 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.4 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.82 
 
 		 483 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.14 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.42 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  41.36 
 
 		 537 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  38.82 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.18 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  39.75 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  39.75 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.08 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.88 
 
 		 464 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  42.25 
 
 		 505 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.09 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.78 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.84 
 
 		 475 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.65 
 
 		 479 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.2 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.38 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.02 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.59 
 
 		 482 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.45 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  43.15 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.08 
 
 		 492 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.92 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  39.08 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>