More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1624 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  44.39 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  42.92 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  43.3 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  42.36 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  42.36 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  37.55 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  39.65 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  40.36 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  40.36 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  40.36 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  40.35 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  42.22 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  40.35 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  40.35 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  40.35 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.39 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  41.82 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  39.47 
 
 		 253 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  41.96 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  40.61 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  40.61 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  40.61 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  42.01 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  41.18 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.03 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  39.01 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  38.64 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  36.21 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  42.01 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  39.39 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  39.56 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  37.33 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  36.55 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  39.46 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  39.46 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  36.75 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  39.47 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  39.11 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.89 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  37.78 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  36.09 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  37.78 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  37.78 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  37.29 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.62 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.56 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  33.65 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  36.61 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>