More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1619 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  560  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  60.35 
 
 		 295 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.95 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  40 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.81 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.02 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.54 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  40 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  35.34 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.55 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 603 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.15 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3095  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.63 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4798  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337539  normal  0.0254161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  31.82 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>