More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1476 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  292  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  43.17 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 196 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  39.69 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  39.69 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  39.69 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.93 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.98 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.85 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.79 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  35.59 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  27.56 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  34.4 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.89 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  45.57 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  27.46 
 
 		 352 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  27.46 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  37.63 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  28.39 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  35.34 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.27 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.34 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  37.78 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  29.69 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  33.65 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.62 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.59 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.59 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>