More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1406 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
484 aa  941  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
587 aa  273  5e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  44.32 
 
 
648 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
643 aa  263  5e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
646 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
627 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
605 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
614 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
607 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
494 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
612 aa  244  2e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
583 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
610 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
605 aa  236  5e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
606 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
513 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
717 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  40.52 
 
 
503 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
630 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  49.24 
 
 
513 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
579 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  39.79 
 
 
525 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
770 aa  223  5e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 
512 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 
562 aa  222  1e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  48.15 
 
 
790 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  45.49 
 
 
511 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
614 aa  217  3e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  46.46 
 
 
511 aa  215  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
511 aa  215  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  49.41 
 
 
513 aa  215  2e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 
513 aa  214  2e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  49.41 
 
 
513 aa  215  2e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
911 aa  213  4e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 
511 aa  214  4e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
844 aa  213  5e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
784 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 
505 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
523 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 
620 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
774 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  42.46 
 
 
773 aa  209  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
511 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
778 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  46.91 
 
 
771 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
533 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
769 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
600 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
775 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  45.3 
 
 
783 aa  206  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  45.3 
 
 
783 aa  206  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
531 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  45.78 
 
 
532 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  43.07 
 
 
599 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 
530 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
518 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
530 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
594 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  40 
 
 
609 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
468 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
772 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  46.09 
 
 
771 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  39.52 
 
 
609 aa  202  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
536 aa  202  1e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
798 aa  201  2e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
536 aa  201  2e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
769 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
548 aa  200  4e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 
769 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  44.71 
 
 
774 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
617 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 
779 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
456 aa  197  4e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
797 aa  197  4e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
795 aa  197  4e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1192 aa  197  5e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  43.15 
 
 
1046 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
775 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
1055 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  42.57 
 
 
1035 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
786 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
836 aa  193  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  44.68 
 
 
786 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
509 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
661 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
786 aa  192  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
763 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
728 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  42.17 
 
 
1035 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
502 aa  191  3e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
389 aa  191  3e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  47.64 
 
 
508 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
470 aa  189  6e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
568 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
969 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1352 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
922 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  3.70631e-07  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
704 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
1276 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
687 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>