268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1388 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  35.54 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.31 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.97 
 
 		 301 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.13 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.13 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  31.46 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  31.99 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  32.3 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.96 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  32.16 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  30.74 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  31.96 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  31.93 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  31.19 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  30.48 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  29.34 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  30.53 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  32.25 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  30.45 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  31.07 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.03 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.97 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.16 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.87 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  29.67 
 
 		 307 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  31.16 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  33.47 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.75 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  27.53 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  28.67 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.43 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  28.67 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.1 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.72 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.8 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.76 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.05 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.76 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.15 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.74 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.59 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  29.01 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  31.99 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  32.14 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.1 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  27.95 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.18 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.37 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  30.85 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  32.14 
 
 		 320 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.18 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.19 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.82 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  30.53 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  28.33 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.85 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  32.18 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  31.25 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.9 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.15 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.63 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.14 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  29.91 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  32.41 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.3 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  29.3 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.08 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  29.1 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  23.91 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>