213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1375 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  100 
 
 
256 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  49.58 
 
 
259 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  50.6 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  50.6 
 
 
259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  51.82 
 
 
253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  48.57 
 
 
261 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  50.61 
 
 
257 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  39.61 
 
 
260 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  46.28 
 
 
250 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  46.56 
 
 
250 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  44.96 
 
 
252 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  45.27 
 
 
250 aa  148  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  48.78 
 
 
265 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  44.02 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  41.83 
 
 
286 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  43.8 
 
 
258 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  40.48 
 
 
253 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.53 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  41.88 
 
 
256 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  36.51 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  41.7 
 
 
242 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  41.63 
 
 
258 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  39.34 
 
 
239 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  45.19 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  48.76 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  35.86 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  37.6 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  39.06 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  42 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  35.98 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  37.6 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  37.6 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  38.96 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  36.9 
 
 
252 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  35.1 
 
 
268 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  38.1 
 
 
256 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  37.98 
 
 
260 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  43.39 
 
 
242 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  34.48 
 
 
251 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
256 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  32.35 
 
 
256 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  36.22 
 
 
247 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  28.63 
 
 
251 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  32.51 
 
 
258 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  32.88 
 
 
254 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  34.74 
 
 
245 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  33.93 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.5 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  33.6 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  33.18 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  27.43 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  29.49 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.83 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  27.54 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  32.62 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  28.35 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.95 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  31.87 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.44 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.88 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  24.71 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.36 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.66 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  33.46 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.69 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.37 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  30.88 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.27 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.23 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25.21 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  25.21 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  26.02 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  21.82 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  30.85 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  26.61 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  30.71 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.1 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.1 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.69 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.48 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.69 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.69 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.69 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.69 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.69 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.69 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  21.36 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  20 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.82 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  23.11 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  28.04 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  25.1 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  25.1 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  32.78 
 
 
398 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  27.57 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>