More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1369 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  100 
 
 
417 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  59.8 
 
 
414 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  60.56 
 
 
436 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  51.23 
 
 
412 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  47.46 
 
 
412 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  50.73 
 
 
412 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  45.73 
 
 
406 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  46.53 
 
 
407 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  44.44 
 
 
417 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  45.32 
 
 
405 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
405 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  45.12 
 
 
413 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
407 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
408 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 
405 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  43.84 
 
 
414 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  47.47 
 
 
400 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
408 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  46.02 
 
 
408 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  44.83 
 
 
430 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  43.78 
 
 
433 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  42.96 
 
 
403 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  47.47 
 
 
400 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  45.16 
 
 
421 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  46.55 
 
 
406 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  47.45 
 
 
402 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  44.97 
 
 
402 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  47.22 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  42.89 
 
 
412 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.22 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  47.7 
 
 
402 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  42.89 
 
 
412 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  43.32 
 
 
412 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  48.03 
 
 
400 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  44.27 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  43.23 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  43.92 
 
 
414 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  47.22 
 
 
402 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  41.93 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  41.77 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  44.11 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  47.19 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  42.26 
 
 
404 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  47.26 
 
 
399 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  47.46 
 
 
410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  42.89 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  46.48 
 
 
399 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  44.92 
 
 
480 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  44.61 
 
 
410 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  44.61 
 
 
410 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  46.43 
 
 
401 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  42.79 
 
 
410 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  44.61 
 
 
410 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  42.79 
 
 
410 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  43.03 
 
 
409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  43.61 
 
 
410 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.12 
 
 
528 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  41.19 
 
 
416 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
405 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 
416 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  38.56 
 
 
405 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  42 
 
 
415 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  40.31 
 
 
413 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  38.62 
 
 
411 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  41.55 
 
 
414 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  39.03 
 
 
411 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  40.59 
 
 
417 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  41.07 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
411 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  36.79 
 
 
403 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  41.73 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  41.77 
 
 
427 aa  236  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  38.26 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.34 
 
 
411 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  34.64 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
438 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  36.1 
 
 
422 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
442 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  30.85 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  31.1 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.73 
 
 
425 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.53 
 
 
428 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  32.05 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  31.13 
 
 
452 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.82 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.75 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.75 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  31.03 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.89 
 
 
435 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.32 
 
 
430 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>