More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1348 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
276 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  57.09 
 
 
274 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  57.09 
 
 
274 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  59.3 
 
 
266 aa  233  4e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  63.67 
 
 
268 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  45.77 
 
 
269 aa  225  5e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  49.21 
 
 
291 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  49.61 
 
 
291 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
275 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  48.05 
 
 
270 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  51.95 
 
 
268 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  9.04095e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  46.18 
 
 
277 aa  214  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  51.76 
 
 
290 aa  213  3e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  46.07 
 
 
282 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
279 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  47.1 
 
 
270 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  46.48 
 
 
274 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  47.94 
 
 
274 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  45.32 
 
 
274 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  50.94 
 
 
290 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  51.69 
 
 
297 aa  200  2e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  48.83 
 
 
267 aa  200  2e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  46.67 
 
 
279 aa  200  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  48.83 
 
 
267 aa  200  2e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  50 
 
 
273 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  48.89 
 
 
289 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  48.52 
 
 
289 aa  197  1e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  45.7 
 
 
270 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  51.12 
 
 
289 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  47 
 
 
283 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  44.19 
 
 
278 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  47.55 
 
 
295 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  43.56 
 
 
271 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
289 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  43.87 
 
 
279 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  44.6 
 
 
275 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  41.15 
 
 
275 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  43.38 
 
 
271 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  45.86 
 
 
275 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  45.11 
 
 
275 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  40.78 
 
 
289 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  36.65 
 
 
293 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  39.22 
 
 
287 aa  155  5e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  42.18 
 
 
274 aa  155  5e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.18 
 
 
294 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  44.74 
 
 
272 aa  152  6e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  35.56 
 
 
293 aa  148  1e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  37.79 
 
 
294 aa  147  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  38.13 
 
 
283 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 
294 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  38.35 
 
 
321 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  42.11 
 
 
286 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 
276 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 
280 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  42.59 
 
 
280 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  41.92 
 
 
278 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  42.59 
 
 
280 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  38.82 
 
 
310 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  38.82 
 
 
310 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  38.82 
 
 
310 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  38.58 
 
 
307 aa  140  2e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  40.68 
 
 
271 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  37.4 
 
 
267 aa  135  6e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  39.79 
 
 
287 aa  135  6e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  38.31 
 
 
271 aa  135  6e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.45 
 
 
292 aa  134  1e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  38.18 
 
 
292 aa  134  2e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  37.8 
 
 
280 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  42.8 
 
 
276 aa  132  4e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  35.74 
 
 
282 aa  133  4e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  38.7 
 
 
277 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  36.74 
 
 
311 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  42.42 
 
 
310 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  39.72 
 
 
293 aa  131  1e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  38.97 
 
 
274 aa  130  2e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  36.61 
 
 
281 aa  130  2e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  36.86 
 
 
306 aa  129  4e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  35.94 
 
 
307 aa  128  1e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 
282 aa  127  2e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  38.4 
 
 
280 aa  127  2e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  39.62 
 
 
273 aa  127  2e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.21 
 
 
276 aa  126  4e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  36.47 
 
 
306 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.8 
 
 
280 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  36.43 
 
 
281 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  35.79 
 
 
292 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
295 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  37.99 
 
 
290 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.85 
 
 
275 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.43 
 
 
280 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.43 
 
 
280 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.43 
 
 
280 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  44.94 
 
 
189 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  39.46 
 
 
277 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  35.02 
 
 
289 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
330 aa  121  1e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.92 
 
 
291 aa  121  1e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.42 
 
 
306 aa  120  2e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  41.96 
 
 
296 aa  119  4e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.1 
 
 
288 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>