More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1248 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  861    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  70.34 
 
 
424 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  71.01 
 
 
425 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  66.83 
 
 
436 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  66.59 
 
 
436 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  66.51 
 
 
441 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  66.83 
 
 
436 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  68.77 
 
 
424 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  67.7 
 
 
432 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  67.54 
 
 
436 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  68.23 
 
 
441 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  66.43 
 
 
439 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  64.15 
 
 
437 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  63.92 
 
 
437 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  68.65 
 
 
441 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  62.75 
 
 
429 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  61.41 
 
 
437 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  60.97 
 
 
437 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  61.9 
 
 
437 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 
419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  63.2 
 
 
430 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  69.57 
 
 
446 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  58.23 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  57.97 
 
 
443 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  62.32 
 
 
438 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  58.06 
 
 
444 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  55.34 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  59.31 
 
 
428 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  59.66 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  57.38 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  56.83 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  59.66 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  56.52 
 
 
439 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  64.2 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  58.81 
 
 
443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 
443 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  57.82 
 
 
446 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  62.75 
 
 
428 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  52.24 
 
 
432 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  52.24 
 
 
432 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  52.76 
 
 
429 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  52.76 
 
 
429 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  52.24 
 
 
433 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 
432 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  55.37 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  49.41 
 
 
438 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 
450 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 
429 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 
430 aa  348  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  44.94 
 
 
430 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  44.58 
 
 
422 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  42.82 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  40.93 
 
 
438 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.87 
 
 
431 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.41 
 
 
430 aa  163  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
416 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.49 
 
 
418 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  32.44 
 
 
411 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.02 
 
 
412 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
416 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.68 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.64 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
408 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.9 
 
 
402 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.75 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.61 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.69 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  31.83 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.69 
 
 
402 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.69 
 
 
402 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.86 
 
 
398 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.73 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
415 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.69 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
398 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
398 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
398 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.1 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.6 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
407 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  29.44 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.89 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.71 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
405 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.54 
 
 
410 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  30.21 
 
 
413 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
411 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.61 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.38 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.98 
 
 
402 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.71 
 
 
412 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.43 
 
 
400 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.43 
 
 
400 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>