More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1244 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  56.56 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  55.8 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  52.65 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  52.65 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  52.21 
 
 		 227 aa  247  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 243 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  51.34 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  48.89 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.51 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>