More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1207 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
324 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  74.32 
 
 
310 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  76.68 
 
 
301 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  79.7 
 
 
300 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  71.92 
 
 
304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  73.2 
 
 
305 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  72.85 
 
 
305 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  72.85 
 
 
305 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  72.85 
 
 
305 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  73.2 
 
 
305 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  71.38 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  70.55 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  66.23 
 
 
303 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  73.29 
 
 
302 aa  430  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  71.96 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  74.16 
 
 
310 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  64.95 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  64.6 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  64.6 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  68.86 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  68.03 
 
 
286 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  65.33 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  65.09 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  67.91 
 
 
305 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  69.34 
 
 
314 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  65.51 
 
 
297 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  67.03 
 
 
297 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  68.71 
 
 
301 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  64.94 
 
 
299 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  60.36 
 
 
341 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  59.46 
 
 
311 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  56 
 
 
326 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  51.82 
 
 
315 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  49.32 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  48.99 
 
 
321 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  52.01 
 
 
290 aa  306  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  52.6 
 
 
305 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  52.23 
 
 
313 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  53.82 
 
 
307 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  50.33 
 
 
320 aa  288  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  45.85 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  46.56 
 
 
346 aa  279  6e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  51.31 
 
 
337 aa  275  6e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  49.62 
 
 
287 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  45.99 
 
 
320 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  53.16 
 
 
304 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  44.36 
 
 
302 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  41.84 
 
 
300 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  43.98 
 
 
299 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  42.47 
 
 
302 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  50.55 
 
 
312 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  40.58 
 
 
316 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  35.57 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  34.75 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  35.23 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  35.23 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  35.23 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  38.75 
 
 
294 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  40.43 
 
 
320 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.23 
 
 
313 aa  199  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  38.16 
 
 
309 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  33.22 
 
 
308 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 
302 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  37.81 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  34.54 
 
 
304 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 
313 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  35.1 
 
 
301 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  34.71 
 
 
303 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 
309 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 
309 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.66 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  34.4 
 
 
298 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  37.32 
 
 
291 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.16 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 
307 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  38.13 
 
 
303 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 
303 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 
303 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  35.11 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 
326 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  35.46 
 
 
339 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
292 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 
289 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 
316 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 
325 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 
336 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 
293 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 
299 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 
326 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>