More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1200 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.57 
 
 
301 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.99 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  52.26 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  49.34 
 
 
324 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  52.26 
 
 
341 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  48.08 
 
 
306 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  46.15 
 
 
345 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  45.08 
 
 
310 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  44.41 
 
 
309 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  41.72 
 
 
293 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  42.21 
 
 
294 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  40.27 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  37.21 
 
 
322 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.24 
 
 
291 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  39.78 
 
 
329 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  40 
 
 
308 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  40.5 
 
 
310 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  35.37 
 
 
325 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  37.88 
 
 
313 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 
309 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.28 
 
 
291 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
305 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
305 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.93 
 
 
314 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  36.11 
 
 
299 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  32.88 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.28 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  40.21 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.57 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  35.96 
 
 
297 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
317 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.17 
 
 
314 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  35.11 
 
 
297 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  34.42 
 
 
294 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  30.38 
 
 
309 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  30.72 
 
 
309 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.72 
 
 
309 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  36.86 
 
 
322 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  30.85 
 
 
311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  36.81 
 
 
309 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
301 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  34.26 
 
 
303 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 
305 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.03 
 
 
302 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  33.56 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  34.4 
 
 
319 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  34.83 
 
 
297 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  35.14 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 
333 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  34.95 
 
 
300 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  34.64 
 
 
300 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  30.33 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  34.15 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  32.99 
 
 
305 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 
300 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  30.74 
 
 
301 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 
298 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  30.95 
 
 
305 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.21 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.42 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  31.29 
 
 
341 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  27.92 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.68 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  36.45 
 
 
325 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  30.38 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.86 
 
 
303 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.86 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.86 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.86 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.86 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  35.71 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.96 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.57 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  30.38 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  32.99 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.79 
 
 
293 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.53 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.79 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  31.51 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  30.48 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.93 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  30.18 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  29.11 
 
 
290 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  29.93 
 
 
297 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  28.81 
 
 
306 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>