More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1071 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  69.86 
 
 		 698 aa  937    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  65.11 
 
 		 721 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  68.95 
 
 		 689 aa  960    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.47 
 
 		 726 aa  916    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 699 aa  1442    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  65.11 
 
 		 694 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  63.26 
 
 		 708 aa  900    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  70.21 
 
 		 691 aa  953    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  57.56 
 
 		 669 aa  801    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  66.56 
 
 		 675 aa  912    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  69.06 
 
 		 712 aa  963    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  65.62 
 
 		 773 aa  910    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  66.25 
 
 		 675 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  65.56 
 
 		 721 aa  900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  66.47 
 
 		 728 aa  928    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  57.17 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.61 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.1 
 
 		 434 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  48.61 
 
 		 434 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  48.61 
 
 		 434 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  48.86 
 
 		 432 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.86 
 
 		 432 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  48.86 
 
 		 432 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 450 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 432 aa  359  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.89 
 
 		 426 aa  359  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  48.87 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.05 
 
 		 395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  49.36 
 
 		 439 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.73 
 
 		 426 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  46.1 
 
 		 434 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  47.72 
 
 		 430 aa  354  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  47.3 
 
 		 439 aa  353  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 439 aa  353  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.45 
 
 		 417 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.29 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.85 
 
 		 441 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 438 aa  351  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45 
 
 		 448 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  47.19 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.19 
 
 		 417 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  46.94 
 
 		 415 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.07 
 
 		 415 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  48 
 
 		 447 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.33 
 
 		 422 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.34 
 
 		 447 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.37 
 
 		 447 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.83 
 
 		 467 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.75 
 
 		 453 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.79 
 
 		 448 aa  339  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.13 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.48 
 
 		 448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.5 
 
 		 451 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 		 439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  43.51 
 
 		 450 aa  337  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.2 
 
 		 477 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  45.27 
 
 		 477 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  44.2 
 
 		 463 aa  336  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.82 
 
 		 469 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.48 
 
 		 537 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  43.65 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  45.32 
 
 		 470 aa  331  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  43.78 
 
 		 473 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  44.95 
 
 		 475 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 		 475 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  44.95 
 
 		 475 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  44.07 
 
 		 469 aa  329  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.81 
 
 		 454 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.02 
 
 		 470 aa  323  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.02 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.15 
 
 		 433 aa  320  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.24 
 
 		 451 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  43.17 
 
 		 476 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  41.15 
 
 		 466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  53.77 
 
 		 303 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  44.06 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  44.06 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  44.06 
 
 		 482 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.05 
 
 		 530 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.8 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  43.65 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  43.54 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  43.54 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.01 
 
 		 444 aa  294  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  51.91 
 
 		 311 aa  291  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.29 
 
 		 426 aa  284  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.5 
 
 		 424 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  42.37 
 
 		 440 aa  281  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 492 aa  280  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.55 
 
 		 425 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  40 
 
 		 424 aa  279  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40.29 
 
 		 425 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 		 680 aa  278  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  39.65 
 
 		 419 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 425 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40.29 
 
 		 425 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.36 
 
 		 450 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.05 
 
 		 425 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 425 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.05 
 
 		 425 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>