54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1038 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  233  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.71 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.23 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  34.15 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  29.2 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  32.52 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  31.4 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  27.43 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  31.82 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  31.82 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  32.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  27.43 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0132  hypothetical protein  32.43 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  29.41 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  34.13 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  26.55 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1186  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  33.67 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  33.78 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  29.84 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  31.07 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  30.59 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  25.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  33.82 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  37.35 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0286  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.248934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  29.66 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  32.61 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  32.61 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  31.52 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  34.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  31.52 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  33.65 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  27.68 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  31.52 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  26.79 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  30.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  25.49 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  24.49 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  31.73 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>