More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0983 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  593  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 361 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  26.76 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  32.13 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.43 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  28.29 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0064  helix-turn-helix, AraC type  27.67 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.585972  normal  0.173321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.77 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  26.94 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 678 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>