43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0977 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  49.07 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  47.33 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  43.13 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.1 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  65 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  43.01 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  60.84 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.7 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  34.89 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  35.64 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.33 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  36.9 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  36.9 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  34.91 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  39.85 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  51.56 
 
 		 383 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  51.56 
 
 		 379 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  51.56 
 
 		 379 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  51.56 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  51.56 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  51.56 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  51.56 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44.06 
 
 		 228 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  51.54 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  36.86 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  50.78 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  33.67 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.55 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  47.66 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  35.66 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.66 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0959  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.1 
 
 		 382 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.261704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.97 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  25.28 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  25.28 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  32.5 
 
 		 103 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2144  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.69 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  32.94 
 
 		 94 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3771  putative transmembrane anti-sigma factor  60 
 
 		 99 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>