More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0961 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  52.23 
 
 
259 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  49.38 
 
 
257 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  51.82 
 
 
259 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  52.03 
 
 
259 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.6 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.09 
 
 
263 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  49.42 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.09 
 
 
263 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.56 
 
 
239 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  51.79 
 
 
262 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  47.39 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  48.45 
 
 
258 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.39 
 
 
262 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.39 
 
 
262 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  51.03 
 
 
258 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  48.83 
 
 
258 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  45.56 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
259 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  49.81 
 
 
263 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  50.43 
 
 
249 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  48.84 
 
 
260 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.64 
 
 
262 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  50.4 
 
 
262 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  51.03 
 
 
263 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  49.81 
 
 
263 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.62 
 
 
263 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.6 
 
 
262 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.62 
 
 
263 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  52 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.21 
 
 
263 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  55.24 
 
 
257 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  49.15 
 
 
249 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  48.06 
 
 
263 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  49 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  48.5 
 
 
241 aa  245  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.59 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  46.46 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  51.5 
 
 
241 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  44.88 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.4 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.08 
 
 
256 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  48.15 
 
 
255 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  47.69 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  46.51 
 
 
215 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.74 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.11 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.6 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  37.08 
 
 
234 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.12 
 
 
256 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  36.33 
 
 
258 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 
234 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.13 
 
 
262 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.13 
 
 
262 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.76 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  34.52 
 
 
256 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  33.73 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  31.27 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.06 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
247 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
247 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  31.51 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.59 
 
 
266 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  28.89 
 
 
315 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  29.96 
 
 
247 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.75 
 
 
233 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  28.25 
 
 
315 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.93 
 
 
221 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 
242 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.54 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.96 
 
 
495 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.6 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.21 
 
 
501 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.31 
 
 
301 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.8 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.66 
 
 
517 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.78 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.13 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.77 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.91 
 
 
332 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.13 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.35 
 
 
302 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.96 
 
 
318 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.95 
 
 
311 aa  85.5  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.11 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.72 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.34 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.44 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.87 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  24.61 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.48 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>