More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0928 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
509 aa  1017    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  51.02 
 
 
507 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.91 
 
 
503 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  42.01 
 
 
497 aa  339  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  40.83 
 
 
520 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  40.24 
 
 
503 aa  309  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  38.63 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  39.3 
 
 
530 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  39.92 
 
 
509 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  36.96 
 
 
518 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  36.7 
 
 
525 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.11 
 
 
552 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.96 
 
 
542 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.96 
 
 
542 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.54 
 
 
511 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.13 
 
 
580 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.32 
 
 
568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  37.45 
 
 
537 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.62 
 
 
573 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.62 
 
 
573 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.11 
 
 
605 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  35.22 
 
 
520 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.39 
 
 
555 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.26 
 
 
569 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.97 
 
 
555 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 
530 aa  246  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  36.93 
 
 
587 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.98 
 
 
555 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  39.21 
 
 
481 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.58 
 
 
622 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  38.04 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.3 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.62 
 
 
569 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  41.27 
 
 
547 aa  230  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  38.68 
 
 
570 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  38.68 
 
 
570 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.05 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.05 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.35 
 
 
618 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.05 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  32.05 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  32.05 
 
 
554 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.05 
 
 
554 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  38.42 
 
 
565 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.23 
 
 
554 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.48 
 
 
574 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.02 
 
 
561 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.65 
 
 
615 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.39 
 
 
597 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.87 
 
 
523 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  36.67 
 
 
564 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.63 
 
 
537 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  31.15 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  35.36 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  30.43 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
569 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  30.71 
 
 
564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  32.27 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
570 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
569 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 
493 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.18 
 
 
489 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
550 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
535 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  29.82 
 
 
537 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
480 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
558 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
555 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  31.61 
 
 
474 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
551 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.55 
 
 
537 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.55 
 
 
537 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.77 
 
 
541 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
553 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
553 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
553 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
553 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  26.48 
 
 
575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  29.72 
 
 
554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 
552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
563 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.77 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.32 
 
 
543 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
553 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>