More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0870 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 424 aa  852    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  69.81 
 
 		 438 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  69.19 
 
 		 437 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  70.53 
 
 		 430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  68.48 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  68.17 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  70.73 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  68.48 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  70.49 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  68.28 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  69.76 
 
 		 431 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 438 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 432 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  69.1 
 
 		 438 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  68.61 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  67.71 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  70.24 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  72.09 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  68.13 
 
 		 436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  68.29 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  69.69 
 
 		 451 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  70.63 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  69.51 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  67.14 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  70.46 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  67.95 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  68.67 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  67.95 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 		 432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  67.14 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  67.95 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  68.19 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  68.43 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  70.39 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  69.42 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  69.17 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  68.19 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  68.43 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  69.4 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  68.86 
 
 		 433 aa  564  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  70.05 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  69.08 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 		 435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  70.67 
 
 		 432 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 433 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 433 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  69.5 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  68.29 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 431 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 421 aa  529  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  62.09 
 
 		 422 aa  528  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 427 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  63.04 
 
 		 419 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 422 aa  521  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>