214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0861 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  100 
 
 
324 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  65.84 
 
 
332 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  62.65 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  62.04 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  62.04 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  61.73 
 
 
323 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  61.73 
 
 
323 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  61.73 
 
 
323 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  61.73 
 
 
323 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  61.73 
 
 
323 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  61.73 
 
 
323 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  61.42 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  62.62 
 
 
328 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  61.42 
 
 
323 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  61.42 
 
 
323 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  61.42 
 
 
323 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  61.49 
 
 
323 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  60.49 
 
 
323 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  60.49 
 
 
323 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  61.42 
 
 
323 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  61.8 
 
 
323 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  60.49 
 
 
323 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  61.18 
 
 
325 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  60.56 
 
 
323 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  60.87 
 
 
325 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  60.56 
 
 
325 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  59.94 
 
 
323 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  60.25 
 
 
323 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  60.87 
 
 
325 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  60.87 
 
 
325 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  60.87 
 
 
325 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  58.7 
 
 
325 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  59.63 
 
 
325 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  59.63 
 
 
325 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  59.06 
 
 
320 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  59.32 
 
 
325 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  59.01 
 
 
325 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  38.2 
 
 
323 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  35.69 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  36.16 
 
 
328 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  36.16 
 
 
328 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  35.46 
 
 
336 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  31.99 
 
 
329 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  32 
 
 
329 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.52 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  32.19 
 
 
326 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  31.48 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  34.12 
 
 
357 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  29.32 
 
 
327 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  31.48 
 
 
329 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  33.75 
 
 
323 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  30.4 
 
 
329 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  32.83 
 
 
377 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  34.01 
 
 
368 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  31.1 
 
 
386 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.23 
 
 
311 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.38 
 
 
327 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.43 
 
 
307 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.49 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.11 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.39 
 
 
311 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.37 
 
 
315 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.25 
 
 
433 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  31.36 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.14 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.7 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30.27 
 
 
328 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.52 
 
 
335 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.96 
 
 
438 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  29.23 
 
 
400 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.78 
 
 
313 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  27.73 
 
 
326 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.04 
 
 
399 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.17 
 
 
379 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.98 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  29.96 
 
 
333 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  35.75 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  36.31 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.84 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.24 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.34 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 
333 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.87 
 
 
444 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.28 
 
 
307 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  29.68 
 
 
307 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  26.28 
 
 
394 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.53 
 
 
399 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  36.31 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.83 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  24.86 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  25.42 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.3 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  35.2 
 
 
307 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  35.2 
 
 
307 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  35.36 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  35.2 
 
 
307 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.42 
 
 
402 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  28.08 
 
 
338 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>