44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0814 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 
422 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.73 
 
 
334 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  33.81 
 
 
401 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 
409 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.14 
 
 
350 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  32.24 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.98 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.08 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.1 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.65 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.81 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.34 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.6 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  30.22 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  29.69 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.18 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  28.75 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.39 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4466  helix-turn-helix domain protein  38.54 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  21.32 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.34 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  29.45 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.36 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.65 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  24.14 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  22.03 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  30.53 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  22.03 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2935  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
128 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
123 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  29.37 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 
139 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 
119 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
139 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 
123 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
147 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2160  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
134 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
139 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
139 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0558597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>