More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0798 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  86.73 
 
 
98 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  81.63 
 
 
97 aa  159  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  42.55 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  47.92 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  48.94 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  49.45 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  50 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  45.56 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  52.78 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  40.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  48.57 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  43.3 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  44.44 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  42.67 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  44.44 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  43.42 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  51.56 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  46.97 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  46.97 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  48.48 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  46.97 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  45.71 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  43.18 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  40.85 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  36.9 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  42.11 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  37.5 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
814 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.68 
 
 
954 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
753 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
1013 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  42.67 
 
 
795 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
1021 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
1021 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
759 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
813 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
1087 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
824 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  35.14 
 
 
744 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
811 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
811 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  36.62 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
754 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
752 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
946 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
699 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  37.31 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
938 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
849 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
834 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
796 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
836 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.5 
 
 
833 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
885 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
750 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.07 
 
 
819 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
1040 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.43 
 
 
826 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
803 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
803 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
813 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
803 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
835 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  38.6 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
744 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  38.81 
 
 
724 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
841 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
866 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  31.88 
 
 
1196 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
806 aa  48.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
824 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
1071 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
831 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
762 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
762 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
748 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
838 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
762 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
1182 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
827 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
836 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
767 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
872 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  40.79 
 
 
937 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>