146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0690 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 383 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  83.96 
 
 		 375 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  76.46 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  76.46 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  75.26 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  75.53 
 
 		 399 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  75.65 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  78.28 
 
 		 373 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  73.74 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  72.4 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  70.98 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  70.6 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  68.11 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  69.79 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  67.8 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  67.09 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  62.37 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  63.92 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  57.25 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  58.18 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  60 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  56.92 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  56.73 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  57.95 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  57.32 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  55.09 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  58.56 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  54.71 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  54.19 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  50.13 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  50.79 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  53.68 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  48.26 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  45.45 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  44.7 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  44.19 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  43.69 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  45.61 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  44.36 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  43.83 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  45.11 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  42.93 
 
 		 423 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  44.56 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  44.19 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  43.86 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  41.34 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  43.47 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  45.31 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.86 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  44.25 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  42.75 
 
 		 412 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  41.71 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  38.26 
 
 		 431 aa  255  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  42.45 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  42.55 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  38.08 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  41.78 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  51.04 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.77 
 
 		 428 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  31.82 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  36.9 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  39.65 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.95 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  38.84 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  40.91 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  40.91 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  40.91 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  36.94 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  38.6 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  37.5 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  36.87 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  36.64 
 
 		 439 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.58 
 
 		 465 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  37.34 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  43.02 
 
 		 190 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  33.49 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  77.5 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  37.31 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  30.69 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  37.23 
 
 		 483 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  35.9 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  33.7 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  33.7 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  31.27 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  35.9 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  32.72 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  36.22 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.95 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.36 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.65 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4252  conjugation TrbI-like protein  32.81 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  31.94 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  32.62 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.06 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  35.18 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  31.09 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  35.57 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  32.79 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>