39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0674 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1209    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  58.33 
 
 
494 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  33.7 
 
 
654 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  33.55 
 
 
654 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  30.09 
 
 
676 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.62 
 
 
672 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.99 
 
 
681 aa  151  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  27.52 
 
 
708 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.09 
 
 
614 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  24.48 
 
 
697 aa  110  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  24.35 
 
 
670 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  28.61 
 
 
771 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1076  hypothetical protein  49.33 
 
 
84 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  27.05 
 
 
668 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  24.71 
 
 
641 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.43 
 
 
605 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.1 
 
 
589 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.43 
 
 
628 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  30.72 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.39 
 
 
688 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  36.05 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.01 
 
 
597 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.8 
 
 
464 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.51 
 
 
607 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.84 
 
 
613 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.05 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.54 
 
 
548 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  46.81 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.56 
 
 
623 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.32 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  25.62 
 
 
595 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.15 
 
 
681 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  30.6 
 
 
604 aa  44.3  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.28 
 
 
642 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.19 
 
 
616 aa  44.3  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  45.45 
 
 
455 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.94 
 
 
582 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  29.93 
 
 
580 aa  43.9  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.71 
 
 
591 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>