More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0644 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  554  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  78.62 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  78.28 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.21 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.29 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  40.64 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.76 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  37.68 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.92 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.48 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.48 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.25 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.48 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.62 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.76 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.31 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.37 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.42 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 603 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  35.31 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.31 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.31 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 299 aa  161  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 295 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.43 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 603 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.19 
 
 		 603 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 309 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 603 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 603 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>