More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0641 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  77.68 
 
 
234 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  76.39 
 
 
234 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  56.22 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  57.94 
 
 
236 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
245 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  56.22 
 
 
233 aa  268  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.94 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  57.51 
 
 
236 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 
234 aa  267  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.99 
 
 
235 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  54.94 
 
 
260 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.94 
 
 
239 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
256 aa  265  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  53.85 
 
 
234 aa  264  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.98 
 
 
235 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.22 
 
 
235 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  54.7 
 
 
242 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
259 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  52.36 
 
 
236 aa  262  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  57.08 
 
 
236 aa  262  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  55.36 
 
 
244 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  54.85 
 
 
240 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.13 
 
 
235 aa  260  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  56.41 
 
 
240 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.08 
 
 
239 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  54.04 
 
 
247 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  54.04 
 
 
247 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.13 
 
 
238 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.99 
 
 
233 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  54.04 
 
 
247 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  53.85 
 
 
249 aa  257  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
233 aa  257  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  58.19 
 
 
237 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  54.27 
 
 
251 aa  256  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  56.65 
 
 
264 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  55.36 
 
 
234 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.85 
 
 
238 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
237 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  55.13 
 
 
233 aa  255  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  52.77 
 
 
239 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  54.74 
 
 
240 aa  254  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.47 
 
 
238 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  53.65 
 
 
234 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  53.62 
 
 
239 aa  254  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  51.93 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  53.97 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  52.97 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  54.27 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
247 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.36 
 
 
239 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  52.77 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.05 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.42 
 
 
237 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  53.59 
 
 
240 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.79 
 
 
237 aa  250  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  54.01 
 
 
240 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  52.36 
 
 
235 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  248  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  51.72 
 
 
234 aa  249  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.57 
 
 
236 aa  248  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.32 
 
 
240 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.79 
 
 
235 aa  247  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  50.63 
 
 
242 aa  247  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.99 
 
 
234 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  51.93 
 
 
234 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  53.22 
 
 
238 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
234 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.72 
 
 
238 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  53.85 
 
 
258 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
236 aa  245  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
234 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.93 
 
 
237 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  245  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.71 
 
 
238 aa  245  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  51.48 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.63 
 
 
247 aa  244  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
235 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  53.22 
 
 
234 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.57 
 
 
237 aa  244  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  53.39 
 
 
236 aa  244  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  50.85 
 
 
237 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  56.78 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>