148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0604 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 415 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  86.51 
 
 		 414 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  77.33 
 
 		 421 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  75.31 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  68.26 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  70.18 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  66.75 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  65.82 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  65.33 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  64.47 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  64.36 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  64.36 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  61.1 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  61.17 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  62.92 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  58.66 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  63.33 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  57.47 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  61.7 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  56.33 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  58.89 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  57.79 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  61.5 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  60.41 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  56.28 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  62.14 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  51.27 
 
 		 392 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  52.03 
 
 		 430 aa  349  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  52.93 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  51.89 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  55.87 
 
 		 386 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  49.75 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  46.55 
 
 		 397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  44.73 
 
 		 384 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  42.96 
 
 		 424 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  42.57 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  42.32 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  44.33 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  42.61 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  42.72 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  42.08 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  40.83 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  39.12 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  41.04 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  40.78 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  41.13 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  41.38 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  41.09 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  41.38 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  39.47 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  39.71 
 
 		 427 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  39.95 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  39.75 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  36.12 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  38.07 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  39.82 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  34.63 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  42.2 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  49.51 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  44.77 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  41.52 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  41.2 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  46.8 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  43.19 
 
 		 459 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  41.55 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  41.07 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  43.37 
 
 		 473 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  43.37 
 
 		 473 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  42.86 
 
 		 472 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  41.07 
 
 		 430 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  39.27 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  40 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  43.5 
 
 		 190 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  41.53 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  36.68 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  35.75 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  34.62 
 
 		 467 aa  136  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  36.11 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  36.11 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  37.77 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  35.29 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  35.98 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  37.57 
 
 		 469 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  36.17 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.8 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  35.64 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  37.31 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  35.98 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  38.61 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  34.98 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  34.76 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  32.27 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  34.55 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  33.16 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  34.83 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  32.68 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  32.68 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  35.03 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  34.55 
 
 		 459 aa  99.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>