184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0552 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  69.91 
 
 		 115 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  48.57 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  40.91 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  42.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.69 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 321 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.77 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.77 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.77 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  36.59 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  33.03 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  29.09 
 
 		 347 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2142  helix-turn-helix domain protein  37.33 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.03 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  33.9 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 283 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  35.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.96 
 
 		 399 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  30.38 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  32.47 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.18 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 446 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.23 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  39.39 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  39.34 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  33.9 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.96 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 244 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>