219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0469 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  100 
 
 		 498 aa  967    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  44.07 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  42.83 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  42.95 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  44.4 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  43.94 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  44.92 
 
 		 484 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  43.74 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  42.74 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  43.87 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  43.28 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  42.62 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  43.96 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  44.07 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  43.83 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  44.42 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  43.66 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  43.33 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  43.33 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  43.83 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  42.16 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  45.74 
 
 		 490 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  44.28 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  43 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  42.36 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  43.69 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  42.36 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  43.96 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  43.18 
 
 		 480 aa  356  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  42.42 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  42.42 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  42.42 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  42.42 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  43.62 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  42.15 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  43.12 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  43.48 
 
 		 483 aa  350  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  40 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  41.74 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.61 
 
 		 466 aa  342  9e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  43.39 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.32 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  41.72 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.42 
 
 		 500 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  39.39 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  39.75 
 
 		 482 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  38.36 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  40.43 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.48 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  39.09 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  39.09 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.79 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  40.38 
 
 		 472 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  39.42 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.35 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  40.54 
 
 		 481 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  40.94 
 
 		 491 aa  309  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  39.39 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  40.04 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  39.34 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  41.25 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  36.48 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  39.84 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  36.93 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  38.6 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  40.83 
 
 		 484 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  40.83 
 
 		 484 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  39.43 
 
 		 485 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  40.51 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  40.3 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  40.3 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  37.21 
 
 		 482 aa  292  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  39.45 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.24 
 
 		 478 aa  292  9e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  40.41 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  39.96 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.4 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.81 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  40.41 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  40.25 
 
 		 485 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  38.25 
 
 		 483 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.25 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  40.09 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.47 
 
 		 484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.45 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  35.26 
 
 		 479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  38.27 
 
 		 481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  38.4 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  38.8 
 
 		 482 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.74 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.83 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.03 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  36.86 
 
 		 486 aa  279  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.58 
 
 		 483 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  38.37 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  35.95 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>